Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PGPEP1Q9NXJ5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms