Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
MED29Q9NX70 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MED29Q9NX70 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms