Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
INTS9Q9NV88 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
INTS9Q9NV88 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms