Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PHPT1Q9NRX4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHPT1Q9NRX4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms