Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.012e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 ABCC10-208ENST00000469856 285 ntTSL 314.72□□□□□ -0.052e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 ABCC10-207ENST00000463024 4542 ntTSL 214.44□□□□□ -0.12e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-207ENST00000558877 758 ntTSL 314.18□□□□□ -0.142e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 SFI1-227ENST00000495107 735 ntTSL 314.16□□□□□ -0.142e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 VWA7-202ENST00000467576 2143 ntTSL 213.99□□□□□ -0.172e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 RCC1-208ENST00000429051 538 ntTSL 312.22□□□□□ -0.452e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.473e-17■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 UVRAG-209ENST00000533454 1823 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.513e-17■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 TCAF1-204ENST00000478172 576 ntTSL 411.17□□□□□ -0.625e-15■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-215ENST00000482601 642 ntTSL 510.84□□□□□ -0.673e-11■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.715e-15■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 MAP4K2-211ENST00000482314 579 ntTSL 310.55□□□□□ -0.724e-8■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 UVRAG-208ENST00000532130 1831 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.813e-17■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 NCBP3-204ENST00000574911 2701 ntTSL 1 (best)9.62□□□□□ -0.872e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 NCBP3-206ENST00000576523 249 ntTSL 29.37□□□□□ -0.912e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 NCBP3-205ENST00000575815 4096 ntTSL 29.35□□□□□ -0.912e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.952e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 IGF2BP3-216ENST00000497563 657 ntTSL 28.16□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 GTDC1-211ENST00000437114 753 ntTSL 56.66□□□□□ -1.343e-11■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 ARPC5-205ENST00000602490 2985 nt6.08□□□□□ -1.442e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 ARPC5-204ENST00000462965 2455 ntTSL 25.55□□□□□ -1.522e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 IGF2BP3-205ENST00000467592 600 ntTSL 53.1□□□□□ -1.913e-6■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 316.5
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 316.5
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-213ENST00000600239 5565 ntTSL 216.2■□□□□ 0.189e-7■■■■■ 316.5
UTP3Q9NQZ2 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 519.47■□□□□ 0.714e-7■■■■■ 316.3
UTP3Q9NQZ2 NCOR2-212ENST00000448008 735 ntTSL 515.02■□□□□ -02e-6■■■■■ 315.7
UTP3Q9NQZ2 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 313.28□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 315.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 315.2
UTP3Q9NQZ2 ZNF100-203ENST00000594401 548 ntTSL 47.75□□□□□ -1.172e-9■■■■■ 315.2
UTP3Q9NQZ2 ZNF782-202ENST00000430274 562 ntTSL 329.02■■■□□ 2.243e-42■■■■■ 315.2
UTP3Q9NQZ2 ZNF782-206ENST00000485322 305 ntTSL 327.58■■■□□ 2.013e-42■■■■■ 315.2
UTP3Q9NQZ2 ZNF782-204ENST00000478850 932 ntTSL 525.88■■□□□ 1.733e-42■■■■■ 315.2
UTP3Q9NQZ2 ZNF782-203ENST00000466833 628 ntTSL 312.61□□□□□ -0.393e-42■■■■■ 315.2
UTP3Q9NQZ2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.211e-7■■■■■ 314.4
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP6-203ENST00000434349 830 ntTSL 517.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 314.1
UTP3Q9NQZ2 COLGALT1-205ENST00000600474 552 ntTSL 49.1□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 314.1
UTP3Q9NQZ2 NBAS-207ENST00000441755 844 ntTSL 35.78□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 314.1
UTP3Q9NQZ2 MNT-204ENST00000572892 556 ntTSL 421.81■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 313.9
UTP3Q9NQZ2 NFKBIA-207ENST00000557100 825 ntTSL 319■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 313.1
UTP3Q9NQZ2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.521e-8■■■■■ 313.1
UTP3Q9NQZ2 NFKBIA-203ENST00000554001 1396 ntTSL 515.64■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 313.1
UTP3Q9NQZ2 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 313.1
UTP3Q9NQZ2 LMAN2-204ENST00000504071 562 ntTSL 219.61■□□□□ 0.735e-34■■■■■ 313
UTP3Q9NQZ2 PTK2-255ENST00000524202 3014 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.968e-11■■■■■ 312.6
UTP3Q9NQZ2 EIF3K-209ENST00000590134 711 ntTSL 29.2□□□□□ -0.949e-7■■■■■ 312.6
UTP3Q9NQZ2 SUN2-211ENST00000455125 872 ntTSL 214.09□□□□□ -0.154e-10■■■■■ 312.5
UTP3Q9NQZ2 SUN2-215ENST00000470642 571 ntTSL 39.61□□□□□ -0.874e-10■■■■■ 312.5
UTP3Q9NQZ2 TRMU-215ENST00000486620 814 ntTSL 316.96■□□□□ 0.311e-9■■■■■ 312.1
UTP3Q9NQZ2 TRMU-213ENST00000485175 731 ntTSL 511.17□□□□□ -0.621e-9■■■■■ 312.1
UTP3Q9NQZ2 KAT6A-204ENST00000418721 3279 ntTSL 210.29□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 312.1
UTP3Q9NQZ2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 311.7
UTP3Q9NQZ2 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.032e-6■■■■■ 311.6
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-221ENST00000489032 561 ntTSL 311.46□□□□□ -0.575e-13■■■■■ 311.6
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-213ENST00000461577 677 ntTSL 211.32□□□□□ -0.65e-13■■■■■ 311.6
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-208ENST00000437733 518 ntTSL 56.79□□□□□ -1.325e-13■■■■■ 311.6
UTP3Q9NQZ2 CSNK1G2-209ENST00000591752 648 ntTSL 518.17■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 311.4
UTP3Q9NQZ2 PIM3-202ENST00000467480 723 ntTSL 233.45■■■□□ 2.954e-20■■■■■ 310.7
UTP3Q9NQZ2 ACER3-214ENST00000534206 834 ntTSL 530.07■■■□□ 2.42e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ACER3-211ENST00000531461 1292 ntTSL 225.3■■□□□ 1.642e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ACER3-207ENST00000530182 551 ntTSL 525.29■■□□□ 1.642e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ACER3-204ENST00000525861 2058 ntTSL 225.08■■□□□ 1.612e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ACER3-202ENST00000525194 846 ntTSL 1 (best)23.72■■□□□ 1.392e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 SPTLC2-203ENST00000554901 1518 ntTSL 1 (best)17.57■□□□□ 0.48e-16■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF236-204ENST00000579322 1659 ntTSL 217.1■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ACER3-201ENST00000278544 3500 ntTSL 1 (best)14.74□□□□□ -0.052e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF236-203ENST00000543926 8206 ntTSL 1 (best)12.96□□□□□ -0.338e-7■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ACER3-210ENST00000531352 2093 ntTSL 1 (best)12.59□□□□□ -0.392e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF236-205ENST00000583095 371 ntTSL 312.26□□□□□ -0.458e-7■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF236-201ENST00000253159 8124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 TMEM9-208ENST00000472411 2892 ntTSL 211.43□□□□□ -0.582e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.638e-37■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.818e-37■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.822e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 KIAA0141-204ENST00000506775 686 ntTSL 38.54□□□□□ -1.042e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ACER3-208ENST00000530334 931 ntTSL 28.45□□□□□ -1.062e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-217ENST00000492919 546 ntTSL 27.87□□□□□ -1.158e-37■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 TFDP2-220ENST00000494656 496 ntTSL 57.53□□□□□ -1.28e-37■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.242e-29■■■■■ 310.5
UTP3Q9NQZ2 JUP-211ENST00000589036 566 ntTSL 415.16■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 309.6
UTP3Q9NQZ2 JUP-209ENST00000465293 432 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 309.6
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.072e-7■■■■■ 309.3
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-213ENST00000471793 1779 ntTSL 219.88■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 309.3
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 309.3
UTP3Q9NQZ2 IKZF1-208ENST00000426121 201 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 309.3
UTP3Q9NQZ2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.578e-7■■■■■ 308.9
UTP3Q9NQZ2 MICA-208ENST00000421350 1005 ntTSL 512.04□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 308.9
UTP3Q9NQZ2 AKT2-238ENST00000581582 655 ntTSL 38.89□□□□□ -0.991e-44■■■■■ 308
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-216ENST00000580888 710 ntTSL 219■□□□□ 0.632e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 SFXN5-220ENST00000490056 906 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.482e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 SFXN5-221ENST00000495208 808 ntTSL 1 (best)17.92■□□□□ 0.462e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-208ENST00000578476 573 ntTSL 217.85■□□□□ 0.452e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 IRF2-208ENST00000510814 568 ntTSL 415.37■□□□□ 0.052e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-235ENST00000584860 1109 ntTSL 314.71□□□□□ -0.052e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-214ENST00000580461 909 ntTSL 213.69□□□□□ -0.222e-20■■■■■ 307.7
UTP3Q9NQZ2 EIF4A1-213ENST00000579139 568 ntTSL 412.84□□□□□ -0.352e-20■■■■■ 307.7
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