Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAB18Q9NP72 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB18Q9NP72 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB18Q9NP72 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms