Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LY9Q9HBG7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LY9Q9HBG7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LY9Q9HBG7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LY9Q9HBG7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LY9Q9HBG7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LY9Q9HBG7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LY9Q9HBG7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms