Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STN1Q9H668 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STN1Q9H668 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms