Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN2Q9H4D0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN2Q9H4D0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms