Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNQ1DNQ9H478 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNQ1DNQ9H478 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNQ1DNQ9H478 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNQ1DNQ9H478 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNQ1DNQ9H478 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNQ1DNQ9H478 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNQ1DNQ9H478 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNQ1DNQ9H478 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
KCNQ1DNQ9H478 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
KCNQ1DNQ9H478 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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