Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RSPH6AQ9H0K4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RSPH6AQ9H0K4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RSPH6AQ9H0K4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms