Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC113Q9H0I3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC113Q9H0I3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms