Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NIF3L1Q9GZT8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIF3L1Q9GZT8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIF3L1Q9GZT8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms