Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AMBRA1Q9C0C7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AMBRA1Q9C0C7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms