Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCO2Q9BYV7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCO2Q9BYV7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms