Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM109Q9BVC6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms