Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CHRDL1Q9BU40 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHRDL1Q9BU40 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms