Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDC1Q9BTX1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NDC1Q9BTX1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms