Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PI4K2AQ9BTU6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PI4K2AQ9BTU6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms