Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTA3Q9BTC8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MTA3Q9BTC8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTA3Q9BTC8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms