Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RETNLBQ9BQ08 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms