Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHOX2BQ99453 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHOX2BQ99453 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHOX2BQ99453 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms