Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA0

PCDHB18P, Putative protocadherin beta-18, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB18PQ96TA0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHB18PQ96TA0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDHB18PQ96TA0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms