Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPS6KC1Q96S38 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPS6KC1Q96S38 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPS6KC1Q96S38 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms