Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SORCS2Q96PQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SORCS2Q96PQ0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms