Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GBP4Q96PP9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP4Q96PP9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 344.2 ms