Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NSMCE3Q96MG7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms