Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGCZQ96LD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCZQ96LD1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms