Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDLIM2Q96JY6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDLIM2Q96JY6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDLIM2Q96JY6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms