Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC45A3Q96JT2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC45A3Q96JT2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms