Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BCANQ96GW7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
BCANQ96GW7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms