Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC35A4Q96G79 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC35A4Q96G79 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms