Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTERF3Q96E29 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MTERF3Q96E29 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms