Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUB2Q96DC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTUB2Q96DC9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms