Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAF2Q96CS3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAF2Q96CS3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms