Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB1CQ92928 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB1CQ92928 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms