Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAD50Q92878 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAD50Q92878 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms