Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMBR1Q8WVP7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMBR1Q8WVP7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms