Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY5

CREB3L4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L4Q8TEY5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CREB3L4Q8TEY5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB3L4Q8TEY5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms