Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF2Q8TEC5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF2Q8TEC5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF2Q8TEC5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF2Q8TEC5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF2Q8TEC5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF2Q8TEC5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF2Q8TEC5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SH3RF2Q8TEC5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3RF2Q8TEC5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3RF2Q8TEC5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms