Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VN1R17PQ8TDU5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VN1R17PQ8TDU5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms