Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELQQ8TDG4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms