Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTLL11Q8NHH1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTLL11Q8NHH1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTLL11Q8NHH1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms