Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NUP35Q8NFH5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NUP35Q8NFH5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms