Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APPL2Q8NEU8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms