Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNBD1Q8NA66 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNBD1Q8NA66 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNBD1Q8NA66 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms