Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AMER3Q8N944 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AMER3Q8N944 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AMER3Q8N944 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms