Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRRC17Q8N6Y2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRRC17Q8N6Y2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC17Q8N6Y2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRRC17Q8N6Y2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1492.7 ms