Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GPBP1Q86WP2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPBP1Q86WP2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms