Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms